Jeszcze nie tak dawno na miejscu nowego obiektu parafialnego były pola uprawne należące do Klucza Wilanowskiego (niegdyś Szaniawskich, Czartoryskich, Lubomirskich , Potockich, Branickich), w sąsiedztwie których pracowali pańszczyźniani chłopi , uwłaszczeni 1864 roku. Klucz nadal istniał do czasu reformy rolnej 1945 r.
W sąsiednim Lesie Kabackim odbywały się reprezentacyjne polowania w latach 20- i 30-tych z udziałem prezydenta RP Ignacego Mościckiego, jego świty i gości Branickich. Uczestnik tych polowań prezydent Warszawy Stefan Starzyński w marcu 1938 r. odkupił od Branickich Las Kabacki dla mieszkańców Warszawy. Miały to być „płuca dla miasta, pełnego wyziewów fabryk i pieców węglowych.”
W pierwszych dniach Września 1939 r. na polach Kabat odbyła się wojenna mobilizacja I Pułku Szwoleżerów Józefa Piłsudskiego. W czasie niemieckiej okupacji w Lesie Kabackim gestapo rozstrzelało około 700 polskich patriotów
W dniach Powstania Warszawskiego 1944 r. Las Kabacki był pod kontrolą Armii Krajowej, jej podwarszawskiego Obwodu „Obroża”.
Dowódcą 5 Rejonu Obwodu „Obroży” Okręgu Warszawskiego Armii Krajowej był w 1944 r. kpt. Antoni Drożyński ps. „Michał”, z którym współpracowała kompania „Krwawiec”, dowodzona przez por. Stanisława Milczyńskiego ps. „Gryf”. Wspomniane kompanie w czasie Powstania organizowały w Lesie Kabackim msze polowe, przyjmowały zrzuty alianckie i rozbitków z oddziałów powstańczych Mokotowa. Parafianie Kościoła Ojca Pio chcą uczcić ich pamięć w postaci obelisku z tablicą pamiątkową. Od wielu miesięcy obelisk ten czeka na terenie miejskim naprzeciw Kościoła na należytą oprawę i tablicę pamiątkową.
Długo najstarsi mieszkańcy Kabat musieli czekać na upragnione nowoczesne mieszkania, budowane na polach Klucza Wilanowskiego. Projekt zagospodarowania Ursynowa Północnego opracował Marek Budzyński, Ursynowa Południowego – Andrzej Fabierkiewicz, Natolina – Jacek Nowicki. To był kwiat warszawskiej architektury lat 70-tych ubiegłego wieku. Mieszkania pasma ursynowsko- natolińskiego, w świetle badań prof. Lecha Królikowskiego (zob. Ursynów wczoraj, dziś i jutro, Warszawa 2014) budowały przedsiębiorstwa i spółdzielnie budowlano-mieszkaniowe, m. in. dla pracownikom umysłowych i środowisk twórczych, ludzi z wyższym wykształceniem o rozwiniętych potrzebach kulturalnych..
Aleję Komisji Edukacji Narodowej – kręgosłup komunikacyjny dzielnicy – budowano od 1994 r. Wcześniej, w 1991 r. powstała zajezdnia Metra na Kabatach, a Spółdzielnia „Osiedle Kabaty”, kierowana przez Franciszka Śliwińskiego, wydała akt erekcyjny budynku przy ul Wąwozowej 18 kwietna 2011. We wdzięcznej pamięci zachowujemy działalność takich spółdzielni jak: SAM 81, „Merkury”, „Klub 200”, „Idealne Mieszkanie”. Na tym tle urbanizacji Kabat powstawała Parafia Świętego Ojca Pio dekanatu ursynowskiego, rejonu Moczydło.
Potrzebę powstania tej parafii władze Metropolii Warszawskiej dostrzegły na początku lat 90-tych ubiegłego stulecia, kiedy zaludniała się świątynia parafii Ofiarowania Pańskiego na ursynowskich Wyżynach. W czerwcu 1996 r. skierowano do budowy nowej parafii na Rybałtów młodego energicznego, wyrosłego na etosie skautowym ks. Ignacego Zygmunta Dziewiątkowskiego (nie tylko lubianego duszpasterza, lecz również świetnego piłkarza – przyp. red.), dotychczasowego wikariusza w parafiach ursynowskich św. Tomasza na Imielinie, oraz błogosławionego Władysława z Gielniowa w Natolinie. Jak pisze ks. Grzegorz Kalwarczyk, „ Na nim spoczął obowiązek zorganizowania nowego ośrodka duszpasterskiego i zbudowania kościoła z zapleczem administracyjnym. Ponad dwa lata zajęło mu zdobywanie odpowiednich zezwoleń, gromadzenie dokumentów i opracowanie projektów architektonicznych. W czerwcu 1999 roku, między innymi dzięki wsparciu ks. prof. Ryszarda Rumianka, ekonoma archidiecezji warszawskiej, został podpisany akt notarialny, który zakończył etap urzędowy organizowania ośrodka duszpasterskiego początkowo pod wezwaniem św. Jana Bosko, którego szczególnie czcił ks. Dziewiątkowski. Pół roku później, 8 grudnia 1999 roku, została erygowana na Moczydle parafia pod wezwaniem św. Ojca Pio, znanego w świecie kapucyna stygmatyka. Parafię erygował kardynał Józef Glemp, prymas Polski, wydzielając ją z parafii Ofiarowania Pańskiego na Wyżynach. Mszę świętą odprawił ks. Dziewiątkowski jej pierwszy proboszcz, w prowizorycznej blaszanej kaplicy”.
Do budowy domu parafialnego, w którym znalazła się kaplica parafialna, przystąpiono 31 sierpnia 2000 roku. Kaplicę tę poświęcił kardynał Józef Glemp 21 kwietnia 2002. Jesienią tego samego roku poświęcenia domu parafialnego dokonał biskup Marian Duś – przewodniczący Prymasowskiego Komitetu Krajowego Pogrzebu Ignacego Jana Paderewskiego. W kaplicy tej, w ostatnich latach, miałem zaszczyt, w ramach modlitwy wiernych, podczas niedzielnych mszy św. przypominać etos życia publicznego Jana Pawła II, wydarzenia historyczne związane z naszym papieżem, z dziejami Warszawy i Ursynowa.
Akt erekcyjny parafii tak określał jej granice: „ Zachodnio –południowa granica nowej parafii biegnie skrajem Lasu Kabackiego na odcinku ulicy Moczydłowskiej do alei Komisji Edukacji Narodowej, skręca następnie na północ i środkiem alei Komisji Edukacji Narodowej dobiega do ulicy Przy Bażantarni, a tą i jej przedłużeniem kieruje się na zachód aż do skrzyżowania ulicy Moczydłowskiej z ulicą Kretonową.”
Powstanie nowych ulic na Kabatach spowodowało korektę granic parafii. W dniu 27 listopada 2008 roku uściślono granice oddzielające parafię Ofiarowania Pańskiego na Wyżynach od parafii Św. Ojca Pio na Moczydle, w rejonie ulic Komisji Edukacji Narodowej , Przy Bażantarni i Stryjeńskich.
Nowy kościół jest odbiciem wysiłku wielu wybitnych architektów, inżynierów budowlanych, techników i plastyków, a także wrażliwości estetycznej księdza proboszcza. Zarys bryły kościoła to dzieło panów Tomasza Gamzyka i Wojciecha Kawęczyńskiego. Jego atrakcyjne wnętrze zaplanował Andrzej Popławski. Konstrukcje to dzieło Piotra Falęckiego. Nad instalacją urządzeń technicznych czuwała Anna Sarama. Grażyna i Hilary Paradowscy – zadbali o prawidłowe geodezyjne zabezpieczenie świątyni, a firma Marka Józefa Szołtuna estetycznie wykonała prace kamieniarskie. Inspekcję budowlaną prowadził Kazimierz Kukulski.
Piękne wnętrz kościoła Chrystocentrycznego z dominującym Krzyżem Świętym w nawie głównej może być zaakceptowane przez wszystkie nurty chrześcijaństwa . Przypomina ono o obowiązku ekumenicznego dialogu w świecie, w którym wspólne wartości chrześcijaństwa są powszechnie deptane i marginalizowane, m. in. w Muzeum Europy w Brukseli..
Święto poświęcenia Kościoła pw. Świętego Ojca Pio 1 października 2017 r. było swoistym podsumowaniem wielu dokonań wspólnoty parafialnej w takich dziedzinach jak:
- edukacja religijna w szkołach kabackich;
- niesienie pomocy charytatywnej biednym, pokrzywdzonym, ofiarom katastrof;
- niesienie pomocy Polakom na Wschodzie, ich szkołom, kościołom i kaplicom;
- uwzględnianie potrzeb duchowych seniorów, w tym ludzi chorych, ludzi w średnim wieku, młodzieży szkolnej i studentów oraz dzieci;
- organizowanie pielgrzymek do Ziemi Świętej, europejskich Sanktuariów Maryjnych, Jasnej Góry, Kodnia, Gietrzwałdu oraz wycieczek śladami turystycznych fascynacji Jana Pawła II.
Każdy z księży pracujących w parafii opiekował się i opiekuje nadal określoną organizacją religijną, korzystając z pomocy sióstr Patrycji, Sabiny, Haliny i Barbary
Struktura społeczna Kabat, wysoki odsetek osób z wyższym wykształceniem, spowodowały spontaniczne powołanie 14 maja 2005 r. ( miesiąc po śmierci Jana Pawła II) organizacji Santo Subito, którą kieruje pan Maciej Trybulec, pełen energii i atrakcyjnych pomysłów, korzystający z rady programowej organizacji. W czasie pielgrzymki do Watykanu w rozmowie z fotoreporterem Jana Pawła II Arturo Mario członkowie pielgrzymki poznali wiele interesujących szczegółów z życia codziennego Papieża. Dyskutowano w macierzystej kaplicy o etosie życia publicznego ks. kardynała Augusta Hlonda prymasa Polski, a także Jana Pawła II i Benedykta XVI. Zorganizowano wiele pielgrzymek i wycieczek, spływów kajakowych. Co roku organizacja zdobywa środki na 4- 5 stypendiów papieskich dla biednej młodzieży. Więź religijną i towarzyską umacniają chóralne pieśni, szczególnie kolęd przy akompaniamencie gitary Prezesa.
Członkowie Santo Subito na Kabatach dobrze zapamiętali słowa Jana Pawła II wypowiedziane na Wzgórzu Lecha do młodzieży 3 czerwca 1979 r.: „Czym jest kultura? Kultura jest wyrazem człowieka. Jest potwierdzeniem człowieczeństwa . Człowiek ją tworzy i człowiek przez nią tworzy siebie. Tworzy siebie wewnętrznym wysiłkiem ducha: myśli, woli , serca. I równocześnie człowiek tworzy kulturę we wspólnocie z innymi. Kultura jest wyrazem międzyludzkiej komunikacji , współmyślenia i współdziałania ludzi. . Powstaje ona w służbie wspólnego dobra i staje się podstawowym dobrem ludzkich wspólnot. Kultura jest przede wszystkim dobrem wspólnym narodu. Kultura polska jest dobrem, na którym opiera się życie duchowe Polaków. Ona wyodrębnia nas jako naród. Ona stanowi o nas przez cały ciąg dziejów. Stanowi bardziej niż siła materialna.”
Życie duchowe parafii prowadzone jest ponadto we Wspólnocie Pio-pozytywnych, Kręgu Domowego Kościoła, Grupie Ojca Pio, Neokatechumenacie, Młodzieżowej Wspólnocie Odnowy w Duchu Świętym , Odnowie w Duchu Świętym dla Dorosłych,
W przestrzeni społecznej Ursynowa, jak w całym kraju, pełnym politycznych emocji i animozji, powstał nowy ośrodek kultury duchowej, który łączy ludzi różnych przekonań politycznych, wiernych chrześcijańskim zasadom życia publicznego Ojca Pio i Jana Pawła II.