Kontrole w niepublicznych placówkach dotyczą prawidłowości pobrania dotacji (weryfikacja liczby uczniów zgłaszanych do dotacji) oraz prawidłowości wykorzystania dotacji (weryfikacja wydatków rozliczanych z dotacji).
W zdecydowanej większości (w 9 przypadkach na 11) nie stwierdzono w opisanym zakresie występowania nieprawidłowości. W przypadku dwóch placówek kontrolujący zakwestionowali liczbę uczniów wykazanych do dotacji z uwagi na fakt, że przedstawiona dokumentacja lub jej brak uniemożliwiała potwierdzenie uczęszczania dzieci do szkoły lub przedszkola. Dodatkowo w jednej z placówek kontrola ujawniła błędy przy wykorzystaniu dotacji, ponieważ przedstawiona dokumentacja nie spełniała wymogów dowodu księgowego, a jednocześnie zakwestionowane wydatki nie mieściły się w katalogu, w ramach którego można je sfinansować z dotacji.
Ponadto, oprócz ww. kontroli, pracownicy Urzędu Dzielnicy Ursynów razem z Biurem Edukacji m. st. Warszawy przeprowadzili postępowania administracyjne dotyczące czterech szkół dla dorosłych. W wyniku postępowań najpierw w formie decyzji administracyjnych wstrzymano ww. szkołom przekazywanie dotacji, a później wezwano organy prowadzące te placówki do zwrotu całej dotacji otrzymanej w 2020 r. Jednocześnie, w powyższych przypadkach, przekazano do prokuratury zawiadomienia o podejrzeniu popełnienia przestępstwa polegającego na wyłudzeniu dotacji udzielonej na podstawie przedłożonego dokumentu poświadczającego nieprawdę.
